息抜きと生物学

お勧めグッズ、バイオ系の内容など 博士課程学生の生態の一例です。

DNA・RNA ~構造の違い~

こんにちは。うちPです。

 


今回は、「DNAとRNA」について

 


以前、

「DNAは設計図の原本」「RNAは設計図のコピー」という例えをしました。

セントラルドグマ - 息抜きと生物学

 

 DNAは設計図の原本なので、壊れてもらっては困ります。

 

逆に、RNAはコピーなので、

 

不要になればすぐに分解される必要があります。

 

そのため、DNAは安定で、RNAは壊れやすくなっています。

 

 

今回は、構造に着目して書いてみようと思います。

 

(いつも通り、厳密な内容ではありません。。。)

 

・目次

 

 

名前

DNAはデオキシリボ核酸RNAリボ核酸です。

DNAは「デオキシ」とついています。

これは、「ヒドロキシ基(OH)が水素原子(H)に置き換わった」という意味です。


これだけだと分かりにくいので

構造を見てみます。

 

構造

5炭糖とリン酸、塩基の3つから構成されており、ヌクレオチドを言います。

(ちなみに、リン酸がないものはヌクレオ”シ”ドといいます。)

 

f:id:Uchi_P:20201109000644p:plain

 

DNAの5炭糖はデオキシリボース

RNAの5炭糖はリボースです。

 

RNAの2'の炭素(C)には、「OH」

DNAの方は「H」がついています。

 


このたった1つの違いが、

DNAは安定で、RNAは壊れやすいという違いを生んでいます。

 


DNAでは、ヌクレオチドが連なって一本の鎖を作ります。


RNAでも、ヌクレオチドが連なって鎖を作ります。

 

f:id:Uchi_P:20201109000738p:plain

 

しかし、隣り合うヌクレオチドのリン酸基と2'のOHが近い位置にいます。
(青丸の2つ)

 


これにより、

このような反応が起きやすくなります。

 

f:id:Uchi_P:20201109013006p:plain

このため、DNAよりもRNAのほうが壊れやすくなっています。

 

 


ということで、今回はDNAとRNAの違いについて、

骨格をメインに書いてみました。

 


これ以外に、DNAとRNAの大きな違いと言ったら、

「塩基」ですね。

 


次回か、次々回か、はたまたいつか、

 

塩基についても書いてみようと思います。

 

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「いも」といえば

こんにちは。うちPです。

 

今週のお題「いも」

 

真っ先に頭に浮かんだ言葉が

 

「いもたれ」

 

。。。。。。

 

 

いもじゃねぇし。。。。。。

 

 

確かに最近、油に弱くなってきています。。。

 

ロースかつ100 gがきつかったときは驚きました。

 

量じゃなくて、油にやられて。。。

 

悲しくなってきますね。

 

 

ちなみに

 

「芋」といえば

 

ジャガイモのスープが好きです。

 

あんまりこってりしてないやつ。

 

胃もたれしちゃうので。。。

 

あとは、マックのポテトはたまに食べたくなります。

(あったかいうちに)

 

ということで、マジでどうでもいい内容でした。

 

そろそろ次は、バイオ系の内容を書こうと思っております。

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コ タ ツ

こんにちは。うちPです。

 

急に寒くなってきましたね。

 

 

タツが始動しました(笑)

 

 

半年ほど前までは、コタツの隣に布団があったので

 

タツに入りつつ、そのまま倒れこんでいました。

 

 

とある事情により模様替えをしたので

 

とある事情 ↓

隣室の騒音 ~対策編~ - 息抜きと生物学

隣室の騒音 ~寝れません~ - 息抜きと生物学

 

タツと布団が離れてしまった!

 

おかげで、コタツで寝ることがなくなりそうです。

 

まあ、まだコタツから出たくなくなるほど寒くはないので

 

大丈夫なだけかもしれませんが。。。

 

 

 

ちなみになのですが、

普段、こんなにコタツタツ文字で見ることがないので、

ゲシュタルト崩壊真っ最中です(笑)。

 

ということで、今回はこの辺で。

 

久々にただの雑記でした。

 

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肉うどん

こんにちは。うちPです。


最近、うどんにハマっています。


以前紹介したTBSのドラマ

MIU404で、うどんを食べるシーンが多かったのが原因です。

MIU404 - 息抜きと生物学

 

特に気に入っているのが

 

キッコーマンの具麺 「牛だし 肉ぶっかけ」

f:id:Uchi_P:20201016042714j:plain


セブンイレブンで見つけましたが、ネットでまとめて購入したほうが安いです(笑)

だいぶ違います(笑) 

 

最後にリンクを貼っておきます。

 


粘性の高いタレに、なんか具が入っている

という感じではなく

しっかりとお肉や玉ねぎが入っています。

醤油やダシもきいており、おいしいです!

 

 

 

麺の上にかけるもよし!

お湯で割って、つけ麺にするもよし!


私はつけ麺が好きです。

 

冷凍うどん400 gに、1袋使っています。

 

ちょうどいい味の濃さになります。

(自覚はないですが、薄味派なのでしょうか。。。?)

 

1人前200 gですが、足りないので1食で400 g食べてます(笑)

 


200 gで約33円の冷凍うどんを使っているので、

 

1食で約180円!

(たれが安いのかうどんが安いのか。。。?)

 

お財布にも優しいですね!

 

 

 

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DNA?遺伝子?染色体?ゲノム?どう違う??Part2

こんにちは。うちPです。

 

今回も

DNA、遺伝子、染色体、ゲノム

について。


前回は例だけで話を進めたので、

今回は多少生物学的な内容にしました。

 

 

DNA

DNAはデオキシリボ核酸Deoxyribo Nulceic Acid)の略で、

化学物質の名前です。

 

安定で、壊れにくい物質なので、

ほとんどの生物は、身体の設計図として用いています。

(参照:セントラルドグマ - 息抜きと生物学 

 

ヒトやマウスなどの真核生物では細胞内の核にあります。

 

f:id:Uchi_P:20200927185003p:plain

図1:DNA

 

DNAは簡単に図のような形の分子で、

塩基の部分(図1の緑丸)が4種類あります。

 

A:アデニン、T:チミン、G:グアニン、C:シトシン

 

です。

 

そして、リン酸と隣のDNAの5炭糖が結合して鎖を作っていきます(図2)。
(正確には5炭糖の3'ヒドロキシ基、左下の-OH)

f:id:Uchi_P:20200927184837p:plain

図2:つながるDNA


1個でもDNA

10個つながってもDNA

1億個つながってもDNA

です。

 

遺伝子

DNAが鎖を作った時の、ATGCの並び順を基にタンパク質を作っていきます。

 

この時、タンパク質の設計図になる部分と、

設計図にならない部分があります。

 

f:id:Uchi_P:20200927182255p:plain

図3:遺伝子

 

タンパク質Aの設計図になる部分が遺伝子A。

タンパク質Bの設計図になる部分が遺伝子B。

 

遺伝子Aと遺伝子Bの間の部分のDNAは、タンパク質の設計図になっていません。

そのような部分が「非遺伝子」です(図3の灰色矢印)。

 

染色体

複数の遺伝子が1本につながっており、その間は非遺伝子となっています。

このようなDNAは、単体で核内にあるわけではありません。

 

様々なタンパク質(ヒストンなど)と結合し、折りたたまれた状態で存在しています。

これが染色体です。

 

ヒトは、常染色体と呼ばれる22種類を各2本ずつ

(父親由来と母親由来)

そして、性別を決定する性染色体を1対(2本)持っています。

合計46本です。(23対46本)

 

性染色体はXとYの2種類あり、女性がXX、男性がXYを持っています。

 

f:id:Uchi_P:20200927182329j:plain

(E. Shröck et al.,Science 273:494-497, 1996)

この図はヒトの染色体です。


生物種によって染色体の本数は異なります。

例えば、チンパンジーは24対48本、マウスは19対38本です。


染色体異常による先天的な障害は数多く知られており、

有名なものは、21番染色体が3本あるダウン症候群でしょうか。

 

 

ゲノム

ゲノム(genome)とは、遺伝子(gene)と全体を表す-omeから作られた言葉です。

 

分子生物学では、

染色体に含まれる

 

すべての遺伝情報

 

です。

 

なのでDNAではなく、RNAを利用しているものでは、

RNAの配列がゲノムになります。

 

2000年頭にはヒトゲノム計画が完了し、ヒトのほぼすべてのDNA配列が明らかになっています。

 

 

 

ということで、少し長めになりましたが

DNA、遺伝子、染色体、ゲノム

について書いてみました。

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DNA?遺伝子?染色体?ゲノム?どう違う??Part1

こんにちは。うちPです。


久々に生物系の内容です。


DNA」「遺伝子」「染色体」「ゲノム

おそらくほとんどの人が聞いたことのあるものだと思います。

 

特に、DNAや遺伝子はよく目にするワード。 

 

 

では、これら4つの違いは何でしょうか?

 

ということで、分子生物学の立場から

「DNA」「遺伝子」「染色体」「ゲノム」

それぞれどういいうものか、2回に分けて簡単に書いてみます。

 

1回目は、以前と同様に設計図の例えを用いて

(以前のブログ→セントラルドグマ - 息抜きと生物学

 

2回目DNA?遺伝子?染色体?ゲノム?どう違う??Part2 - 息抜きと生物学は、今回よりも生物っぽい内容にする予定です。

 

 

 

では早速

 

23階建てビルの設計図の例で考えてみましょう。

この設計図は、階ごとに1冊にまとまっているとします。

 

f:id:Uchi_P:20200922222051p:plain

 

文字がDNAです。

文字がつながって、意味のある文章になったものが遺伝子です。

f:id:Uchi_P:20200922215026p:plain

例えば

「ああああ息抜きと生物学かかかかかかか」

このような文字列があったとき、1文字1文字がDNAです。

意味が分かるのは「息抜きと生物学」ですね。

これが遺伝子。

 

「あああ」とか「かかか」など、意味のない部分は非遺伝子といいます。

普段目にする文章では、意味のない文字列はないですが。。。

 


そして文字は紙など、どこかに書かれています。

文字だけで存在はしません。

 

文字が紙に書かれページを作ります。

 

そして、ページを糊付けし、表紙を付けて1冊の1階の設計図が完成します。

設計図は、文字だけでなく紙や糊などを含んでいます。

 

これが染色体です。

 

各階の設計図がそれぞれ2冊ずつ、合計46冊の設計図を持っています。

 

f:id:Uchi_P:20200922215824p:plain

 

なぜ23階建てのビルにしたのかというと、

 

ヒトは1番染色体から23番染色体まで持っているからです。

 

そして、合計46冊の設計図に書かれている、

 

文字によるすべての内容がゲノムです。

 

ということで

 

DNA=文字

遺伝子=意味のある文章

染色体=本

ゲノム=全部の本の文章

 

ということになります。

 

 

次回は、もう少し生物学的な内容で、

 

「DNA」「遺伝子」「染色体」「ゲノム」

 

について書いてみようと思います。

 

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日本分子生物学会

こんにちは。うちPです。

 

(※全て個人の感想です。)

 

昨日、日本分子生物学会(MBSJ)の演題登録の締め切りがありました。

 

そして、今年からすべて英語になりました。

 

規模が大きく、様々な分野の内容があるので、

学生が初めて参加する学会としてちょうどよかった気がするのですが

英語だとハードルが上がってしまう気がします。。。

 

もちろん、英語が苦手な私も不安です(笑)

 

 

また、元々は神戸で行われる予定でしたが、

 

コロナウイルスの影響でオンライン開催に。

 

大きな学会のため、出店している企業も多く、

企業ブースを見るのも楽しみだったのですが残念。。。

 

発表を聞くのはオンラインの方が好きなのですが、

発表するとなると、聞き手の様子がわかりにくく、やりにくいんですよね。。。

 

これまでに無い新しい形の学会になるので、

どんな感じになるのか楽しみ半分、不安半分といったとこでしょうか。

 

まあ、兎にも角にも久しぶりの学会参加になるので、

 

楽しむぞ!!

 

 

 

 

 

神戸行きたかったなぁ

神戸で牛食べたかったなぁ

(※全て個人の感想です。)

 

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隠蔽捜査にはまってます。

こんにちは。うちPです。


ちょうど本のことを書こうと思ったら、

今週のお題も本に関するものでしたね(笑)

 


元々、読書はあまり好きではなく、

読書感想文も

「面白かった」「つまらなかった」

といった感想しかありませんでした(笑)

 

 

しかし、最近になって

本を読みたいと思うようになり

今野敏の「隠蔽捜査」を読みはじめました。


これが面白くて、

寝る前に読んでるのですが、熱中してしまい、

気づいたら外が明かるいってこともありました。。。

 


警察ものですが、現場の刑事ではなく、キャリアの警察官僚目線の物語です。

 

主人公は

 

警察庁長官官房総務課長 竜崎伸也警視長。 

 

階級でいうと、警視総監、警視監についで3番目です。警察署の署長が警視や警視正。警視の上が警視正警視正の上が警視長です。まあ、偉いということです。

 


彼は、国家を守るために心身をささげるという信念を持って働いており

原理原則を重視することを第一としているため、周囲から変人扱いをされています。


第1作では

ある殺人事件が起きます。

はじめは普通の事件と思われていましたが、

後に、警察組織を揺るがす大きな事件となってしまいます。

 

この事件の対応について、

警察上層部と対立する竜崎。

 

そんな中、家族の不祥事が発覚してしまいます。

原理原則を重視している竜崎が、これらの事案をどのように対処していくのか。


これらの経験から竜崎がどのように変わっていくのか。


これまでの刑事ドラマや小説とは全く異なる作品だと思います。

 


そして、2020年9月現在、

第8作目(+スピンオフ)まで出ています。


ちなみに、まだ第2作目までしか読んでないので、

今後が楽しみです。

 

ちなみにテレビドラマ版もあるそうです。

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ミロ 気に入りました!

こんにちは。うちPです。

 

 

大学に登校できる時間も増え、下宿生活に戻ってきました。

 

下宿生活の一番の問題は

 

食事

 

毎日作るのも面倒だし、栄養とか考えるのも大変です。。。

 

世の母親って大変だなぁと思う日々です。

 

 

結局、冷凍食品やパスタとサラダ、インスタントお味噌汁

 

などになってしまいます。。。

 

 

ビタミンとか鉄分とか、取れている気がしません(笑)

 

そこで、私が知人に紹介されたのが

 

ミロ


ネスレ日本 ミロオリジナル 240g

です。(一番下に楽天市場Yahoo!ショッピングのバナーもあります。) 

 

 

チョコレート風味の粉末で、水や牛乳に溶かして飲みます。

 

私は、冷たい牛乳に溶かして飲んでいます。

 

ミルクココアみたいな感じです。

 

普段は牛乳は飲まないのですが、

ミロのついでに摂取してます。

 

 

ネットの口コミを見ると、

「おいしくない」という評価も見ますが、

 

私は結構好きです。

 

豆乳に溶かして飲んでいる人もいるようですね。

 

水に溶かすと、粉感があり、麦芽の風味が強い気がします。

 

 

ビタミンも取れますが、

 

カルシウムと鉄分がしっかりとれるようです!

 

↓のホームページに紹介があります。

実はいちばんすごい?!他ののみものとくらべてみよう | 麦芽飲料「ネスレ ミロ」

 

鉄分が足りないと、貧血になり

 

疲れやすくなったり、倦怠感、頭痛などの症状が出ます。

 

 

私も、ミロを飲み始めてから

 

疲れが取れやすく、元気になったような気がします!

(コントロールがないのでなんとも(笑))

 

 

実験をするにしろ勉強するにしろ

 

体調がすぐれないとなかなか進捗できませんからね。。。

 

 

ミロ


ネスレ日本 ミロオリジナル 240g

 

おススメです!!

 

 

 

一つ難点を上げるのであれば

 

溶かしにくいこと

 

ですね。

 

もともと玉になって溶けにくいうえに、

 

ミロ15 gに牛乳150 mL なんです。

 

10倍希釈かよ!

 

ということで、

 

ミロの簡単な溶かし方を紹介します。

 

1. コップにミロの粉を入れる。

f:id:Uchi_P:20200828021009j:plain

(ピントがコップに。。。) 

 

2. 少量の牛乳(水)を加える。

粉の量の半分ちょっとぐらいだと思います。

(写真は水で溶かしています。)

f:id:Uchi_P:20200828021040j:plain

 

3. ソーサ―などで混ぜる、というか練る。

私は竹串2本で混ぜてます。(手の届くところにあったから)

f:id:Uchi_P:20200828021104j:plain

 

4. 玉がなくなり、どろどろのペースト状になったら適当に牛乳(水)を加える。

f:id:Uchi_P:20200828021132j:plain

 

という感じです。 

 

玉になって溶けにくい試薬を、スターラー無しで混ぜるときも

同じようにすると溶かしやすいですね。

 

 

というこうとで、

 

今回はミロの宣伝をしてみました。

 

まだまだ暑いですが、健康に気を付けていきましょう!!

 

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怖い話

こんにちは。うちPです。

 

今週のお題「怖い話」

 

f:id:Uchi_P:20200819022338j:plain



 

ということで、2年前の夏

 

夜の実験室で体験したことを書いてみます。

 

もしかしたら、苦手な方もいるかもしれません。

 


私のいるキャンパスは木々に囲まれています。

特に、私の研究室はキャンパスの端の方の建物の5階にあり、

実験室の窓からは、3階建ての資料館的なものと木々しか見えません。

夜になると資料館も閉まるため、真っ暗になります。

 

 

夜、といってもそんなに遅い時間ではありませんでした。

 

ただ、その日はみんな早めに帰っており、

 

実験室には私一人でした。

 

 

実験をしていると

 

 

「コンコン」

 

 

と窓ガラスをノックするような音が聞こえてきました。

 

5階です。誰かいるはずもありません。


窓の方を見るのですが、外は真っ暗。

 

 


窓ガラスには、明るい室内がはっきりと映ります。

 


すると再び窓の外から

 

 

「コンコン」

 

 

と音がしました。


外を見るために窓ガラスに近づくと。。。

 

 

「ゴンゴンゴンゴン!!」

 

 

窓をたたくような大きな音がしました。

 

びっくりして窓の外を確認すると、、、

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

f:id:Uchi_P:20200819021053j:plain

 

スズメバチでしょうか?

明るかったため、窓ガラスにぶつかってきたようです。


心霊的な怖さはありませんが

こんな間近でハチに会うなんて、、、

ガラス越しでよかった、、、


ハチの正面顔なんて珍しいので、

写真を撮らせてもらいました。


以上、怖い(?)話でした。

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